Je sproeier is gewoon te groot voor de lucht die het blok kan aanzuigen met het luchtfilter gemonteerd.
Door zonder luchtfilter te rijden, trekt de motor gemakkelijker lucht binnen waardoor dit een compensatie is voor de te grote sproeier.
Heb je de klepspeling ook al eens gecontroleerd/gesteld?
Bougiekleur al eens bekeken want die zal, als je een poos met luchtfilter hebt gereden, wel zwart zijn.